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Computational Biology of Transcription Factor Binding

(Gebundene Ausgabe, Englisch)

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Beschreibung
Transcriptional regulation controls the basic processes of life. Its complex, dynamic, and hierarchical networks control the momentary availability of messenger RNAs for protein synthesis. Transcriptional regulation is key to cell division, development, tissue differen- ation, and cancer as discussed in Chapters 1 and 2. We have witnessed rapid, major developments at the intersection of computational biology, experimental technology, and statistics. A decade ago, researches were struggling with notoriously challenging predictions of isolated binding sites from low-throughput experiments. Now we can accurately predict cis-regulatory modules, conserved cl- ters of binding sites (Chapters 13 and 15), partly based on high-throughput ch- matin immunoprecipitation experiments in which tens of millions of DNA segments are sequenced by massively parallel, next-generation sequencers (ChIP-seq, Chapters 9, 10, and 11). These spectacular developments have allowed for the genome-wide mappings of tens of thousands of transcription factor binding sites in yeast, bacteria, mammals, insects, worms, and plants. Please also note the no less spectacular failures in many laboratories around the world.
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Technische Daten


Erscheinungsdatum
13.09.2010
Sprache
Englisch
EAN
9781607618539
Herausgeber
Humana Press
Serien- oder Bandtitel
Methods in Molecular Biology
Sonderedition
Nein
Seitenanzahl
454
Auflage
1
Einbandart
Gebundene Ausgabe
Bandzählung
674
Schlagwörter
Annotation, ChIP-seq, Genome browsers, Motif discovery tools, Promoter, Statistics, Transcriptional regulation, cis-Regulatory modules, gene expression, genes, genome, molecular biology, sequence analysis, transcription
Thema-Inhalt
PSB - Biochemie PSAX - DV-gestützte Biologie/Bioinformatik
Höhe
254 mm
Breite
17.8 cm

Transparenz & Sicherheit

Hersteller: Humana, Europaplatz 3, Heidelberg, Deutschland, 69115, ProductSafety@springernature.com, Springer Nature Customer Service Center GmbH

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