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Mass Spectrometry Data Analysis in Proteomics

(Broschiert, Englisch)

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Beschreibung
Mass Spectrometry Data Analysis in Proteomics is an in-depth guide to the theory and practice of analyzing raw mass spectrometry (MS) data in proteomics. As MS is a high throughput technique, proteomic researchers must attend carefully to the associated field of data analysis, and this volume outlines available bioinformatics programs, algorithms, and databases available for MS data analysis. General guidelines for data analysis using search engines such as Mascot, Xtandem, and VEMS are provided, with specific attention to identifying poor quality data and optimizing search parameters. Several different types of MS data are discussed, followed by a description of optimal methods for conversion of raw data into peak lists for input to search engines. Choosing the most accurate and complete databases is emphasized, and a report of available sequence databases is included. Methods for assembling expressed sequence tags (ESTs) into assembled nonredundant databases are provided, along with protocols for further processing the sequences into a format suitable for MS data. Mass Spectrometry Data Analysis in Proteomics describes publicly available applications whenever possible.
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Technische Daten


Erscheinungsdatum
19.11.2010
Sprache
Englisch
EAN
9781617376443
Herausgeber
Humana Press
Serien- oder Bandtitel
Methods in Molecular Biology
Sonderedition
Nein
Seitenanzahl
320
Auflage
1
Einbandart
Broschiert
Einbandart Details
Trade Paperback (US)

Hersteller: Humana Press, Europaplatz 3, Heidelberg, Deutschland, 69115, ProductSafety@springernature.com, Springer Nature Customer Service Center GmbH

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