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Structural and mechanistic studies of RNA-ligating deoxyribozymes

Almudena Ponce-Salvatierra (Unbekannter Einband, Englisch)

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Beschreibung
In structural terms, the differences between functional RNA and DNA molecules are rather dramatic. RNA adopts complicated folds within various ribozymes and riboswitches. For example, some ribozymes, like group II introns or the ribosomal RNA, are organized by means of tertiary interactions to an overwhelming level of complexity, only comparable to the one of proteins. Despite the fact that DNA and RNA are virtually identical in terms of building blocks, DNA generally adopts much simpler conformations. The majority of known DNA structures lack long-range tertiary interactions. One reason for the conformational simplicity of DNA appeared to be the absence of the 2‘-OH group, resulting in greater chemical stability of DNA and rendering it suitable for its role as a long-term storage molecule of genetic information. In contrast, the catalytic properties of synthetic DNA catalysts (deoxyribozymes) were expected to depend on the ability of these molecules to fold into compact teritary structures, as in the case of ribozymes or protein enzymes. However, until this work was reported, no structure of any deoxyribozyme was known, thus leaving the question “how does DNA fold in order to perform catalysis?” largely unanswered. The scope of this thesis was to understand how DNA molecules fold in 3D to achieve enzymatic properties, therefore I decided to investigate a DNA catalyst able to ligate two RNA molecules. Here I report the structure of this DNA-based RNA ligase in complex with its RNA product.
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Technische Daten


Erscheinungsdatum
10.03.2017
Sprache
Englisch
EAN
9783863877958
Herausgeber
Mensch & Buch
Sonderedition
Nein
Autor
Almudena Ponce-Salvatierra
Seitenanzahl
154
Auflage
1
Einbandart
Unbekannter Einband
Einbandart Details
Laminiert
Schlagwörter
DNA, genetic information,, nucleic acids, biomolecule, ribozymes, Crystallographic, catalytic RNA, proteins
Thema-Inhalt
PNRR - Physikalische organische Chemie
Thema-Zusatz
für die Berufsbildung / Berufsausbildung, für die Hochschulausbildung, für die Erwachsenenbildung

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