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Synthetische Oligonukleotide und deren Eigenschaften in der parallelen Hybridisierung
Carolin Ahlborn (Broschiert, Deutsch)
Optischer Zustand
Beschreibung
In der vorliegenden Arbeit wurde gezeigt, dass DNA-Tetradecamere, welche ausschließlich Adenin und Thymin als Kernbasen enthalten, so funktionalisiert werden können, dass sie stärker an den komplementären Gegenstrang binden als analoge DNATetradecamere mit N-4-Ethylcytosin und Guanin als Kernbasen. Dies konnte in Lösung mittels UV-Schmelzkurven und auf DNA-Microarrays gezeigt werden. Zur… Verstärkung der Basenpaarung mit Adenin wurden statt Thymidinresten Desoxyuridinreste mit Pyrenylsubstituenten an der 5-Position eingesetzt. Dass diese Kernbasen selektives Basenpaarungsverhalten zeigen, konnte ebenfalls in Schmelzkurvenexperimenten nachgewiesen werden. Zur Stabilisierung terminaler T:A-Basenpaarungen wurden verschiedene, sogenannte molekulare Kappen eingesetzt. Hierbei wurde am 5'-Terminus neben einem Cholsäure- und einem Pyren-Pyrrolidin-Rest auch ein Trimethoxystilbensubstituent verwendet. Die Stabilisierung von Basenpaarungen mit Adenin am 3'-Terminus wurde durch die Anknüpfung eines Anthrachinonsäurerestes an der 2'- Position von 2'-Amino-2'-desoxyuridin erreicht. Die Kombination aus terminalen Kappen, Pyrenylsubstituenten und Nukleotiden mit versteiftem Ribosering („locked nucleic acids“, LNA) innerhalb einer Oliognukleotidsequenz führte zu einer Erhöhung der Schmelztemperatur des Duplexes mit dem Gegenstrang um 23.5 °C gegenüber dem des unmodifizierten Kontrollstrangs (5'-TAATTTTTAATAAT-3'). Dies konnte in UVSchmelzkurvenexperimenten nachgewiesen werden. Um eine sequenzunabhängige Affinität der Gegenstränge zu erreichen, wurden auch Derivate des Cytidins eingesetzt. Der achtfache Einbau von N-Ethylcytosin in die Sequenz 5'-CGGCCCCCGGCGGC-3' ergab z.B. eine Erniedrigung des Duplex-Schmelzpunktes um 24.3 °C.[…] Dieses Produkt haben wir gerade leider nicht auf Lager.
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Technische Daten
Erscheinungsdatum
17.09.2007
Sprache
Deutsch
EAN
9783940333148
Herausgeber
sierke VERLAG - Sierke WWS GmbH
Sonderedition
Nein
Autor
Carolin Ahlborn
Seitenanzahl
212
Auflage
1
Einbandart
Broschiert
Einbandart Details
Klebebindung
Schlagwörter
DNA, Microarrays, Molekulare Erkennung, Isostabile DNA
Thema-Inhalt
PNT - Kristallografie
Höhe
210 mm
Breite
14.8 cm
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