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Chemical modification of RNA using DNA catalysts

Lea Büttner (Unbekannter Einband, Englisch)

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Beschreibung
Site-specific labelling of RNA is of significant importance in many areas of chemical biology. The synthesis of high-quality fluorescent or spin-labelled RNA is a challenging task and often requires multiple steps. This thesis describes the development of new strategies for RNA labelling based on catalytically active DNAs, called deoxyribozymes or DNA catalysts. A new and efficient method was established that allows direct, postsynthetic labelling of long RNAs at internal ribose residues under mild conditions and in only one step. For implementing this DNA-catalysed RNA labelling approach, we capitalised on a 2’,5’-branched RNA-forming deoxyribozyme that was shown to accept various labelled mononucleotides as substrates for ligation to adenosine branch-sites. In addition, a new deoxyribozyme-based technique was developed for the ligation of labelled RNA fragments to synthesise long modified RNA samples for spectroscopic studies. This provides a valuable, mild alternative to traditional enzymatic approaches and substantially adds to broaden the scope of preparative deoxyribozyme applications. The DNA-catalysed ligation was used for the synthesis of spin-labelled riboswitch RNAs.
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Technische Daten


Erscheinungsdatum
29.07.2014
Sprache
Englisch
EAN
9783868446395
Herausgeber
sierke VERLAG - Sierke WWS GmbH
Sonderedition
Nein
Autor
Lea Büttner
Seitenanzahl
236
Auflage
1
Einbandart
Unbekannter Einband
Schlagwörter
CuAAC, FRET measurements, Riboswitch, RNA labelling, Modified GTP-analogues, Deoxyribozyme
Thema-Inhalt
P - Mathematik und Naturwissenschaften PN - Chemie PNRD - Katalyse PNN - Organische Chemie
Höhe
210 mm
Breite
14.8 cm

Warnhinweise und Sicherheitsinformationen

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